Para solucionarlo hay que reparar la tabla dañada.
Desde una sesión de telnet, nos conectamos a mysql y abrimos la bdd en cuestión:
mysql -h localhost -u root -p
Y escribimos nuestra contraseña de admin de la bdd.
Después:
use asteriskcdrdb; check table cdr; repair table cdr;
Y con estas sentencias repararemos la bdd.